Les arbres jouent un rôle majeur dans les écosystèmes.

Leurs racines situées sous la couche de sol riche en matière organique récupèrent les éléments nutritifs (magnésium, calcium, phosphore, potassium, etc...) et les recyclent dans les rameaux et surtout les feuilles qui fourniront à l'automne un excellent paillis. En effet, ces feuilles vont nourrir la vie biologique du sol qui va remettre à disposition les éléments nutritifs pour les plantes. La boucle est bouclée !
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Au contact de la roche-mère, les racines créent de l'argile qui sera utilisée par les vers de terre pour générer le complexe argilo-humique nécessaire à la fertilité du sol.

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Les arbres apportent  de la fraîcheur, un abri pour la faune. 
Par contre, ils concurrencent les légumes du potager avec des racines qui vont profiter de la présence d'un sol riche et humide, et génèrent de l'ombre.
Il convient donc de tenir compte de ces impacts lors du positionnement du potager, qui nécessite beaucoup d'ensoleillement en particulier en démarrage de saison.